Кафедра образована в 1954 г., как кафедра факультетской хирургии, санитарно-гигиенического и педиатрического факультетов. С 2004 г. кафедру возглавляет д.м.н. проф. А.С. Ибадильдин.
С момента организации кафедра занимается учебно-методической, научной работой по актуальным проблемам острого живота, торакальной, сердечно-сосудистой хирургии, портальной гипертензии, создана школа хирургов. На сегодняшний день кафедра продолжает традиции, сохраняя преемственность, совершенствует учебно-методическую и научно-практическую работу, внедряя инновационные технологии в процессе обучения, миниинвазивные вмешательства на органах грудной клетки, брюшной полости, малого таза. В настоящее время на кафедре работают 14 сотрудников из них д.м.н. – 4, к.м.н. – 6
На Конгрессах, съездах хирургов, конференциях профессора, доценты и ассистенты достойно представляют КазНМУ, РК выступают с докладами и организуют эти форумы. В 2009г., в дни КазНМУ, проведена международная конференция на тему «Перитониты». Участие в XVI международном Конгрессе хирургов – гепатологов стран СНГ. Научный потенциал реализуется в издании монографий, учебников, учебных пособий, публикациях в международных, Республиканских изданиях, подготовке научно-педагогических, врачебных кадров.